Aan zee is de breedte van de vallei niet meer dan 150 meter, hier staat ook de kerk van de Moeder van God, die blijkbaar werd gebouwd op de plaats van een oude tempel. In 1957/1958 werden de eerste opgravingen uitgevoerd door de archeologen vereniging West- Kreta. Daarbij werden waardevolle overblijfselen van gebouwen en objecten ontdekt die, naast vele andere aanwijzingen, het bestaan van een tempel van de god Asclepius suggereren. In 1957 kwam er per ongeluk een kleine, prachtige tempel Asklepios aan het licht.
De internationaal bekende archeoloog Nikolaos Platonas meldt dat er in Lissos de overblijfselen zijn van een veelhoekige muur, delen van gebouwen, overblijfselen van thermale baden, ruïnes van granieten kapellen, een klein theater uit de Grieks-Romeinse periode, baden voor de behandeling van zieken. De hellingen rond de kleine vallei van Agios Kirkos zijn vol met graven, die niet in de rots zijn uitgehouwen, maar elk graf is een klein gebouw.
De ingangen van deze graven, die vaak zelfs twee verdiepingen hebben, zijn zo klein dat er slechts één (niet al te zwaarlijvige) persoon past. Veel van deze graven zijn van binnen gepleisterd met mortel en in zeer goede staat - deze graven worden beschouwd als de meest indrukwekkende op het eiland.
De hoogtijdagen van Lissos lagen waarschijnlijk rond 40 v. Chr. tot het Romeinse rijk. Er was een kleine tempel in Dorische stijl gebouwd op grote, gehouwen stenen. De opgravingen vonden een groot aantal grote en kleine offer beelden die de god Asklepios, de godin "Ygia" en Pluton voorstellen. De meeste werden zonder hoofd gevonden; hun productie gaat terug tot het einde van de Hellenistische en Grieks-Romeinse tijdperken. De meeste figuren zijn klassiek.
Van de tempel van Asklepios zijn nog steeds delen en de ronde bogen zijn overgebleven. Iets verderop, was er een watersysteem dat was aangesloten op de bron van het heiligdom. Bovendien werden veel kleinere, gouden voorwerpen gevonden die getuigen van de rijkdom van deze kleine stad en die tegenwoordig te bewonderen zijn in de archeologische musea van Chania en Heraklion.
Lissos was ook beroemd om het water van de lokale geneeskrachtige bronnen en is een groot water sanatorium geworden met bezoekers uit heel Kreta en zelfs van de noordkust van Afrika. Het stadje heeft altijd goede relaties onderhouden met andere steden in het westelijke deel van Kreta, zoals Yrtakina, Siia, Eliros of zelfs Kalamadi, wellicht diende het zelfs als haven van Yrtakina.
De wandeling vanuit Paleochora duurt ongeveer 3,5 uur, vanuit Sougia 1,5 uur. Neem voldoende water mee.
Het lijkt erop dat van al deze oude steden alleen munten werden geslagen in Lissos. De munten toonden zeesymbolen, helmen, sterren van de Dioscuri, boog en pijlkoker.
